Ngày 21/7/2025, Cục Hải quan ban hành Công văn 15428/CHQ-NVTHQ hướng dẫn việc xử lý số tiền thuế giá trị gia tăng (GTGT) nộp thừa trong khâu nhập khẩu.
Công văn này nhằm hướng dẫn cơ quan hải quan và doanh nghiệp thực hiện thống nhất việc bù trừ, hoàn trả và kê khai điều chỉnh đối với khoản thuế GTGT đã nộp thừa.
1. Người nộp thuế được xử lý tiền thuế GTGT nộp thừa như thế nào?
Căn cứ Điều 60 Luật Quản lý thuế 2019, trường hợp người nộp thuế có số tiền thuế đã nộp lớn hơn số tiền phải nộp thì được lựa chọn các phương án xử lý:
- Bù trừ với các khoản tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt còn nợ;
- Trừ vào số tiền thuế phải nộp của kỳ tiếp theo;
- Đề nghị hoàn trả số tiền thuế nộp thừa nếu không còn nghĩa vụ thuế phải nộp.
Trường hợp doanh nghiệp đề nghị hoàn trả tiền thuế nộp thừa, cơ quan quản lý thuế có trách nhiệm xem xét và ban hành quyết định hoàn trả hoặc thông báo lý do không hoàn trả theo quy định.
2. Quy trình xử lý tiền thuế GTGT nhập khẩu nộp thừa
Theo hướng dẫn tại Công văn 15428/CHQ-NVTHQ, cơ quan hải quan nơi phát sinh khoản tiền thuế GTGT nộp thừa sẽ thực hiện kiểm tra hồ sơ và thông tin khai báo của doanh nghiệp.
Trường hợp hồ sơ hợp lệ, chính xác:
- Cơ quan hải quan tiếp nhận và xử lý hồ sơ;
- Ban hành quyết định hoàn trả tiền thuế nộp thừa;
- Phối hợp với Kho bạc Nhà nước thực hiện hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước.
Trường hợp hồ sơ chưa phù hợp, cơ quan hải quan sẽ thông báo để doanh nghiệp bổ sung hoặc điều chỉnh theo quy định.
3. Thời hạn giải quyết hoàn tiền thuế GTGT nộp thừa
Theo quy định tại Thông tư 38/2015/TT-BTC được sửa đổi, bổ sung bởi Thông tư 39/2018/TT-BTC, trong thời hạn 05 ngày làm việc kể từ ngày nhận được hồ sơ hợp lệ đề nghị hoàn tiền thuế nộp thừa, cơ quan hải quan thực hiện:
- Ban hành quyết định hoàn trả tiền thuế;
- Thông báo kết quả xử lý cho người nộp thuế.
Nếu doanh nghiệp không đủ điều kiện hoàn trả, cơ quan hải quan sẽ có văn bản thông báo lý do theo quy định.
4. Doanh nghiệp cần kê khai điều chỉnh sau khi được hoàn thuế
Sau khi cơ quan hải quan hoàn trả tiền thuế GTGT nhập khẩu nộp thừa, doanh nghiệp có trách nhiệm:
- Thực hiện kê khai, điều chỉnh số tiền thuế GTGT đã được xử lý nộp thừa với cơ quan thuế quản lý trực tiếp;
- Theo dõi việc điều chỉnh trên hồ sơ thuế theo đúng quy định.
Cơ quan hải quan sẽ cung cấp thông tin về việc hoàn thuế cho cơ quan thuế quản lý doanh nghiệp để phối hợp theo dõi.
Doanh nghiệp cần lưu ý
Việc xử lý tiền thuế GTGT nộp thừa cần đảm bảo đúng hồ sơ, đúng trình tự và có sự đối chiếu giữa cơ quan hải quan, cơ quan thuế và doanh nghiệp.
Doanh nghiệp nên chủ động rà soát các khoản thuế nhập khẩu, thuế GTGT đã nộp để kịp thời thực hiện bù trừ hoặc đề nghị hoàn trả khi phát sinh khoản nộp thừa.
Đọc thêm: Giải Pháp Cấp Bách Khi Tài Khoản Định Danh Điện Tử Doanh Nghiệp Chưa Được Duyệt Sau 01/07/2025
———————————–
📞 Liên hệ với MHD ngay hôm nay để nhận tư vấn miễn phí: Văn phòng tại TP.HCM
🌍 Địa chỉ: 168 Trần Lựu, Phường An Phú, Thành phố Thủ Đức, Thành phố Hồ Chí Minh Văn phòng tại Hà Nội
🌍 Địa chỉ: 20 Đường 23, KĐT.TP Giao Lưu, P.Cổ Nhuế 2, Quận Bắc Từ Liêm, Hà Nội
🌐 Website: mhd.vn
☎️ Hotline: 1900 98 99 68
📧 Email: info@mhd.vn
